合成生物学 | Xz's blog

合成生物学: 合成生物学学习笔记

目录

# 1. 论文阅读: 1-1. LigandMPNN 1-2. MODIFY 1-3. EpHod 1-4. DeepGO-SE 1-5. GraphEC

# 2. ESM相关: 2-1. 使用 ESMFold 预测 3D 结构并保存为 PDB 文件

# 3. Rosetta: 3-1. Rosetta介绍 3-2. Score（计算结构的能量） 3-3. The Packer: Optimizing Sidechains （侧链优化） 3-4. Minimization Finding Deeper Energy Wells 3-5. Relax：精炼结构 3-6. Constraints：限制条件 3-7. Fold tree：折叠树 3-8. Symmetry：对称

上次更新: 2025/07/04, 10:53:42

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